Tauragės Jovarų (penktoji) vidurinė mokykla pradėta statyti 1978 metais rugpjūčio 1 dieną. Naujoje mokykloje mokslo metai prasidėjo 1979 metų spalio mėnesį. Mokinius ir mokytojus pasveikino 40 naujų kabinetų, sporto salė, aktų salė, valgykla, biblioteka, aikštynas. Pirmuosius 1979–1980 mokslo metus šioje mokykloje pradėjo 46 pedagogai, mokėsi 1053 mokiniai. Pirmuoju mokyklos direktoriumi tapo Valentinas Pocevičius. Jis vadovavo iki 1984 metų. Nuo 1984 metų iki 1988 metų direktoriavo Algirdas Medeikis. 1988 metais direktoriumi tapo Eugenijus Šaltis, o nuo 1993 metų mokyklai vadovauja Algimantas Kaminskis.

Nuo 1997–1998 mokslo metų mokykla pasirinko ekonominę mokymo pakraipą. Ugdytiniai mokosi choreografijos. 1996 metais Lietuvos sveikatos apsaugos ministerija įtraukė mokyklą į sveikatą stiprinančių mokyklų tinklą.. Nuo 1998 - 1999 mokslo metų sėkmingai integruojasi į mokyklos bendruomenę kitakalbiai mokinai.

1999–2000 mokslo, t.y. savo 20-uosius darbo metus, mokykla pradėjo turėdama 1070 mokinių. Savo žinias ir energiją mokiniams dalino 82 pedagogai, 9 mokyklos mokytojai jau turėjo metodininkų vardus, daugelis kitų buvo apsigynę vyresniojo mokytojo vardą.

Per 20 metų Jovarų vidurinę mokyklą baigė 936 abiturientai. Dar per beveik dešimtmetį – 448 mokiniai. Kai šių mokslo metų pabaigoje išleis 74 paskutiniuosius abiturientus, per 29-erius savo kaip vidurinės mokyklos gyvavimo metus Jovarų mokykla iš viso bus įteikusi 1458 brandos atestatus.

Nuo mokyklos įkūrimo jai priklausė Dacijonų pradinio ugdymo skyrius, o nuo 2007 metų ir Dauglaukio pradinė mokykla.

Visuomet šioje mokykloje buvo ugdomi rajono specialiųjų poreikių mokiniai.

2007–2008, paskutiniais vidurinio ugdymo metais, mokykloje mokosi 782 mokiniai, dirba 66 mokytojai (23 metodininkai). Mokykla pasiekia puikių ugdymo rezultatų: mokiniai sėkmingai laiko valstybinius egzaminus, dalyvauja įvairiuose projektuose.

2008–2009 mokslo metus Jovarų mokykla pradės kaip pagrindinio ugdymo institucija.